预防手术部位感染方式较多，手术全过程应严格遵循无菌操作原则进行操作，无菌操作原则为手术室减少术者感染重要规章制度。合格的外科医生均有较好的无菌操作观念，患者与医生处于相对隔离状态，通过保持患者清洁程度，尽可能减少感染的可能。术后可应用盐水、碘伏冲洗存在污染可能的伤口，有利于减轻伤口感染。

手术部位感染有时与患者本身状态有关，如患者皮肤或脂肪层较厚。另外，如果手术方式为胃肠道手术或手术时间较长，局部组织损伤可能相对较重，伤口感染可能性会明显增加。为减少伤口感染可能性，应注意将伤口彻底清洗，并且在清洗后应用减张线或局部、全身应用抗生素控制，预防感染，可以减少伤口感染的可能。