扁平疣变成褐色的斑，不一定是好转，还可能是由于其他因素所致。扁平疣是由人乳头瘤病毒感染所引起的一种常见的病毒性皮肤病，主要表现为面部、手背等处出现扁平、隆起于皮肤表面的小丘疹，可以单发，也可以多发。

扁平疣皮损部位局部表皮增生，所以通常是凸出于皮肤表面的丘疹。但是随着时间的延长，扁平疣的颜色有可能加深，是因为局部病毒刺激黑色素细胞产生过多黑色素所致。有时病毒复制不活跃，或由于自身免疫机能的影响，导致局部疣体增生减缓，扁平疣可以变得比较平，成为一种斑状，而不是隆起于平面的丘疹。此时可能是好现象，表示局部的病毒增生、刺激不活跃。但是局部的病毒并没有被完全清除，当机体免疫下降时还可能再次活跃，刺激局部疣体再次增生，形成隆起的皮损。