怀孕后孕妇查出丙肝病毒感染，一般可以继续妊娠，但需要注意以下几点：

1、生产时尽量缩短分娩时间，保证胎盘的完整性，避免羊膜腔穿刺，尽可能减少新生儿暴露于母血的机会，降低感染风险。通过丙肝病毒核酸检测可监测婴儿丙肝病毒感染情况；

2、可以在分娩和哺乳期结束后给予母亲抗病毒治疗。丙肝阳性的母亲进行母乳喂养是否可以导致婴儿感染，目前国内外研究尚无明确定论。但对于有症状的母亲，特别是病毒载量较高或有乳头破损的情况，建议避免母乳喂养，同时应避免将食物咀嚼后喂给婴儿。