临床大部分导致植物神经功能紊乱的原因，属于非病理性，如精神和心理因素，但也有病理因素导致的植物神经功能紊乱，具体如下：
1、非病理性因素：长期处于精神紧张、焦虑，或者压力等情绪下，或者更年期导致激素水平改变，引起的植物神经的调节紊乱。主要由交感神经和副交感神经协调支配，当交感或者副交感协调产生紊乱，就会出现一系列临床症状。主要受大脑皮层和下丘脑支配，如果出现紊乱后，可以造成所支配心脏的功能、腺体分泌、消化系统调节，或者神经系统，以及睡眠、精神各方面出现障碍；
2、病理性因素：如Shy-Drager综合征，即直立性低血压。主要是因为调节血压的自主神经产生问题，就出现直立时血压降低。还有周围神经血管出现问题，比如雷诺现象、雷诺病，或者红斑肢痛症等，也属于植物神经功能紊乱导致的疾病。
