先兆流产的患者应用黄体酮后仍然流血，可能存在以下几种情况：

1、染色体异常导致的先兆流产，应用黄体酮并无作用，仍会发生真正的流产；

2、先兆流产时出现的出血，可能来自宫腔内，应用黄体酮后，宫腔内的出血未完全停止，而是逐渐停止。所以患者在打黄体酮后的一段时间内，还可能有阴道内少量出血，但通常情况下出血量不会增加，而是逐渐减少，并且颜色会从鲜红色变成暗红色、褐色，最后消失；

3、患者不是因黄体功能差或体内孕酮水平低引起的先兆流产，有可能是因甲状腺功能异常导致。这种情况下需针对病因处理，若状腺功能减退，需要补充小剂量甲状腺片，具体用药需要结合临床，以医生的面诊指导为准。

若黄体功能不全，除补充黄体酮外，患者还需要适当休息，禁止性生活。