阴茎疼痛可以由炎症、外伤等引起，另外也可以在疲软或勃起时出现疼痛。阴茎疼痛的原因主要有：
1、炎症：包皮炎、龟头炎、甚至尿道炎等，以上情况都可以引起阴茎的不适、瘙痒或者疼痛；
2、阴茎外伤：较多见，比如阴茎嵌顿、阴茎系带断裂等。当阴茎疼痛，但无红肿时候主要考虑以下两种情况：海绵体炎症，可以是无菌性炎症；海绵体硬结症，是由于自身免疫原因导致阴茎白膜下出现炎性斑块。这种情况在勃起时，会出现牵拉性疼痛以及弯曲。
因阴茎疼痛到医院就诊时，医生会对疼痛的特点、部位、持续时间等进行综合判断。