在发生咽喉部感染时会出现咽喉炎症，这时有时需要应用抗生素来治疗。由于咽喉部大量的细菌属于杆菌或链球菌，因此对头孢类药物和青霉素类药物相对比较敏感，在出现细菌感染的咽喉炎症时，可以用头孢类抗生素和青霉素类抗生素来治疗。
大部分上呼吸道感染，包括鼻炎、咽炎和喉炎都是由病毒感染所导致。因此大部分病人在出现上呼吸道感染之后，不需要大量应用抗生素，而只需要对症治疗，可以先休息，多饮水，注意保暖。很多病人随着病程进展，一般在7天症状就会自愈。
因为大部分病人的上呼吸道感染是病毒感染所导致，而只有少部分细菌感染的病人，可能会出现咽喉部炎症不容易痊愈，这时可以给予一定程度的抗生素。如果部分病人对头孢类或者是青霉素类抗生素过敏，也可以选取大环内酯类抗生素。由于咽喉部感染通常并非非常特异性感染，因此普通的广谱抗生素即可达到治疗目的。
