反复尿路感染在临床上推荐疗程需要更长，通常建议为2-3周左右，如果为单纯尿路感染，可能3-7天即可。如果患者反复出现尿路感染，细菌可能在某些程度上具有耐药倾向，治疗上需要做尿的细菌培养，以及药物敏感测试，才能够准确知道是哪种细菌导致的感染，以及对哪种抗生素更敏感，根据体外试验的结果指导临床，通常有更好疗效。
疗程需要2-3周的长疗程方案进行治疗，不要症状消失就停药，需要复查尿常规、C反应蛋白等感染性指标，待尿中白细胞完全恢复正常，甚至尿细菌培养加药敏等尿细菌学检查也转阴时才能停药，否则尿路感染仍容易反复。对于反复的尿路感染，需进行泌尿系B超检查，了解上尿路是否存在问题，治疗时需要考虑到某些反复发作的尿路感染，如果与性生活相关，可在性生活后，服用一次剂量的头孢，或复方新诺明等预防感染。
