淋菌性尿道炎的治疗，核心是抗生素，对于淋菌性尿道炎而言，早发现、早治疗，在药物的选择方面，推荐应用头孢类的抗生素，如头孢曲松、头孢克肟，其他的抗生素推荐左氧氟沙星等喹诺酮类药物。如果沙眼衣原体和支原体的感染不能排除，应当联合应用多西环素或者阿奇霉素，具体用药需要在专业医师的指导下进行。同时要嘱患者多饮水，忌食辛辣刺激的食物，戒除酒精，性伴侣要同时治疗，暂停性生活，同时要处理好自己的衣物、被褥等物品。
淋菌性尿道炎是特异性尿道炎，致病菌是奈瑟氏双球菌，可分为前尿道炎和后尿道炎。前尿道炎除了膀胱刺激症状以外，主要的是有大量的黄绿色脓液分泌，夜间可以有痛性勃起。后尿道炎除了排尿刺激症状以外，会有排尿困难症状，严重的时候可以导致急性尿潴留。后尿道的炎症如果进展，可以波及到前列腺和精囊，因此对于淋菌性尿道炎的治疗，应当是早发现、早治疗，以避免并发症。
