男性导尿术时一般采用两次消毒程序，具体如下：

1、初次消毒程序：一般应用导尿包的外包装消毒包，左手戴手套，右手持镊子夹持消毒棉球。先消毒阴阜、阴茎、阴囊、大腿内侧，然后以左手提阴茎向后推包皮露出龟头，沿尿道口向外向后消毒，一直消毒到冠状沟处。此时初次消毒完成，将外包装放置在载物台；

2、第二次消毒：再次消毒双手、铺巾，然后检查相应的导尿用具。第二次消毒一般采用内包装消毒包，双手戴手套。此时应当用纱布裹住阴茎，左手向后推包皮露出尿道口，沿尿道口直到冠状沟处加强消毒，最后一个棉球仅消尿道外口加强消毒。