大部分情况下，卵巢囊肿，包括卵巢癌都没有症状，所有卵巢癌发现基本都是晚期，也很难早期筛查。对有些有症状的卵巢囊肿，比如囊肿特别大，压迫膀胱会有尿频症状，向后压迫直肠可能会有便秘、大便困难的症状。还有对于年轻的女孩，有卵巢的畸胎瘤，在运动剧烈运动的时候突然发生剧烈腹痛，可能会有囊肿扭转，此时是急症，需要手术把卵巢、卵管切掉。如果有卵巢囊肿，尽早看医生，尽早解决问题。
卵巢囊肿一般不会导致不孕，但是有一种卵巢囊肿可能会影响生育，就是子宫内膜异位囊肿。子宫内膜异位症是很多患者因为治疗不孕不育时才会发现。至于巧囊导致不孕不育的因素，理论有很多，但是确切原因还不清楚，可能是分泌细胞因子对受精过程有一些影响。
大部分卵巢囊肿对月经周期没有影响的，但是有个别的囊肿，比如泡沫细胞瘤、颗粒细胞瘤分泌雌激素，如果高雌激素状态，可能会影响患者的月经，绝经后的妇女可能会有绝经后的阴道出血，子宫内膜厚等表现。
