引起新生儿脑损伤的原因较多，但是治疗方法大多类似。未满月的新生儿，主要针对性应用脑保护剂，例如营养神经药物，包括神经节苷脂或鼠神经生长因子等药物促进神经细胞保护、减少脑水肿对神经细胞损害。部分治疗包括低温疗法和亚低温疗法，减轻脑水肿对脑部损害。

年龄较大、体重4kg以上、40天以上儿童可以进行手法康复治疗，包括运动疗法和传统推拿、按摩、小儿捏脊等治疗，同时也可运用物理因子治疗，包括脑电仿生治疗、脑部磁疗、水疗、婴儿游泳以及药浴等。