比较常见的肠结石是结肠结石，即大肠中的结石，通常是由粪石形成。这种结石大部分见于便秘患者，粪便在大肠中的时间长，比如3-4天。而大肠有吸收水分的功能，将这些粪便中的水分吸收完之后，大便就干结，会嵌塞到肠管中形成粪石，部分也称为结石。
小肠比较少见这种结石，如果胆囊与小肠、十二指肠发生了内瘘，即胆囊和小肠发生相通，胆汁流到肠道中时，就可能会形成肠结石。形成的原理与胆结石相同，是胆汁的物理和化学性质发生改变。可以理解为胆道的结石流到肠道中，或者胆汁在肠道中形成结石。