核磁共振检查本身没有任何副作用，但是在高场强的环境中做检查，核磁共振有一些禁忌症。

绝对禁忌症的患者包括有心脏起搏器、神经刺激装置、心脏瓣膜置换，特别是人工金属瓣膜，脑内动脉瘤夹闭金属性物质、眼内金属异物、内耳植入物、金属假体、假肢、假关节等。此类患者绝对不能进入磁共振检查室；相对禁忌人群包括妊娠3个月妇女、高热惊厥、检查部有铁质性物质、体内有治疗泵、幽闭恐惧症患者。

所以磁共振检查本身没有副作用，但是由于有强大磁场，会有禁忌症。