儿童特应性皮炎治疗方法较多，基础治疗是保湿润肤，需要长期坚持润肤让皮肤长期处于滋润状态，可以明显减少特应性皮炎复发概率。护肤剂剂型多种多样，常用包括乳剂、霜剂，以及油剂、水剂、喷剂等。不同季节、不同区域、不同皮疹状况，甚至相同时间不同部位护肤剂选择不同。首选治疗药物是外用糖皮质激素药膏，虽然家长不愿意用激素，但对于特应性皮炎使用糖皮质激素不可避免，在医生指导下规律外用糖皮质激素药膏安全性较好。
儿童常用糖皮质激素是弱效或中效激素，副作用主要是局部皮肤副作用，如色素沉着、色素减退即肤色不均，极少出现全身副作用。生长发育抑制、满月脸、水牛背等全身不良反应多发生于长期口服或注射糖皮质激素的患者。
部分慢性反复发作特应性皮炎患者外用药物时可以采用湿包裹治疗，即涂抹药物后用浸湿且不流水的纱布包裹，但此类方法不能用于急性期特应性皮炎。另外婴幼儿操作难度较大，部分特殊特应性皮炎患者还需要注射或口服药物，例如西替利嗪滴剂、氯雷他定糖浆等。
