儿童再障由于他粒细胞、红细胞、血小板减少，主要临床表现为贫血、出血和感染。
儿童再障的发病起病一般都比较缓慢，病情严重程度与贫血严重程度相关，大部分孩子早期表现是贫血，脸色苍白和气促，随着病程进展这部分孩子容易合并感染，表现为口腔黏膜溃疡以及呼吸道感染，反反复复，而且用抗生素治疗效果不好，甚至于严重时会发展为败血症。
这一部分孩子可能对治疗反应不好时，可以进展为严重的重型再障，这部分孩子需要以后做移植治疗，部分的孩子对治疗反应不好时也可以病情迁延发展为慢性疾病。