肠炎一般认为是非特异性结肠炎，考虑主要是溃疡性结肠炎或克罗恩病两种疾病。相对而言，溃疡性结肠炎发病率可能会更高，而且治疗相比于克罗恩病可能更容易起到效果。从西医角度，治疗一般选用美沙拉嗪，疗效时不好可能会选用激素治疗，中药在治疗溃疡性结肠方面也有一定效果。

俗称的肠炎，也就是急性胃肠炎的情况下，如果是因为饮食不慎、饮食不洁引起的急性胃肠炎，患者首先要进行饮食控制。如果出现恶心、呕吐伴有腹泻，可以使用调节肠道菌群的药物。另外，还可以使用中药中的肠胃康等药物进行治疗。