服用治疗幽门螺杆菌的药物出现腹泻，应考虑与药物有关。治疗幽门螺杆菌通常是4种药物联合应用，包括一种质子泵抑制剂，两种消炎药，以及一种兼有杀灭幽门螺杆菌作用的胃黏膜保护剂，即铋剂。在很多患者应用铋剂之后，会出现常见的副作用，即大便颜色发黑、大便次数增多。但不除外在服用幽门螺杆菌的药物治疗期间出现其它原因，导致消化道出血，所以可以进行大便化验。

除此之外，因为相对疗程是10-14天，有些患者会比较敏感，比如在服用抗生素之后，可能也会出现大便次数相对增多的情况。因此如果明确没有既往病因，即目前在服用根除幽门螺杆菌的药物，又出现腹泻，应考虑是否与服用的药物存在相关性。