卵巢早衰可影响患者当前生活质量，还可影响长远身体健康，甚至影响寿命。女性性征的维持主要是卵巢功能正常，卵巢每个月均可有一个卵泡正常发育、成熟和排卵。但是如果卵巢衰竭，体内没有正常的雌、孕激素，可影响患者的生活质量和寿命。
卵巢早衰患者因为卵巢骤然衰退，雌激素水平降低，可出现潮热、盗汗、失眠、烦躁、记忆力衰退、阴道干涩，同时可导致性生活困难、盆腔器官脱垂，还有压力性尿失禁、反复泌尿生殖道感染。从长远来看，卵巢早衰后因为激素水平下降，女性容易出现心血管疾病和代谢性疾病，比如高血压、心脏病、糖尿病、冠心病等，还容易出现骨质疏松。
同时，卵巢早衰后激素水平降低，也可导致患者记忆力衰退，使阿尔茨海默病发生率增加，这些病变均可严重影响患者的生活质量，甚至影响寿命。
