骨髓移植主要通过分别在患者和供者之间抽血，进行HLA的高分辨配型，也有部分医院会做低分辨或中分辨配型。高分配型一般是指A、B、C、D2、DQ5个位点，其每个位点均有两个等位基因，即需要看十个位点。有一半相同位点时，如父母和子女之间有一半相同，即为半相合，而全相合为十分之十，即完全相同。

兄弟姐妹之间有四分之一的几率为全相合，但因之前的独生子女政策，现在通常采用半相合的移植方式。此外去骨髓库做配型筛查亦可，中华骨髓库现在应该有一百二十万且逐年增加，因此会有越来越多的患者受益。若在骨髓库不能配制成功，则现在还可使用脐血干细胞移植，脐血库亦是重要途径，相对要求会较低，也不一定需要达到全相合水平。