头上长痣，是由于该患者在胚胎时期来源于神经嵴的黑素细胞向表皮移走的过程中，在头皮某一部位的表皮内偶然性聚集，形成头皮的黑素细胞痣。表皮内的黑素细胞痣，随着胎儿的生长及时间推移，黑素细胞痣的痣细胞向真皮内移动，形成皮内痣或交界痣、复合痣。

痣是可以发生在人类皮肤任何部位的皮肤损害，每个人皆有可能存在痣，只是痣的数量多少、大小，以及分布的区域不同而已。发生在头部的痣，通常皮肤损害开始为色素性斑点，随着年龄增长，痣也在不断增大，形成色素性丘疹，或者疣状、带蒂。

​在头皮上的痣可能呈现黑色，随着时间推移也可能色素脱失，表现为无色素或粉白色的痣。头上的痣通常多是良性，患者可以不予处理。如果由于梳头刺激，痣发生变化，可以行手术切除。