神经内镜近十年发展迅速，根据目前发展态势，未来神经外科所有系统的肿瘤，都能够运用神经内镜切除，但目前没有达到这种技术水平。但神经内镜也存在缺点及适应症，在掌握其适应症的基础上，更好的运用神经内镜，可将肿瘤切除范围更加的广泛。
神经内镜治疗效果较好的肿瘤，主要为颅底部位肿瘤，包括中央颅底区、侧颅底肿瘤。颅底肿瘤包括垂体瘤、脑膜瘤，相对儿童较为多见的颅咽管瘤，较难治疗的肿瘤，比如脊索瘤，侧方生长的脑膜瘤，包括胆脂瘤，以及各类颅神经鞘瘤，都可运用神经内镜进行手术治疗。除颅底外，脑实质内跟脑室有关系的肿瘤,运用神经内镜进行治疗也是很好的选择。
脑实质里存在的肿瘤需要进行减压，则进行小骨窗治疗的意义不大，如胶质瘤，目前是采取开颅显微操作，国外有些会运用小骨窗，对颅压不高的胶质瘤采取神经内镜的方式进行治疗。
而对于脊髓脊柱神经内镜的应用也比较广泛，目前神经鞘瘤均是运用神经内镜治疗，其技术上也比较成熟。