阴道的乳酸杆菌少或无，说明阴道内菌群环境发生变化，此时有可能会发生阴道异常菌群的增生，导致阴道炎的发生。女性的阴道内通常以乳酸杆菌作为优势菌群，因此不容易患有阴道炎。但是在特殊情况下，如女性机体抵抗力下降、怀孕期间或患有糖尿病等疾病，都可能导致阴道内pH值改变，阴道内菌群环境的改变，从而导致原来占有优势的乳酸杆菌逐渐减少甚至消失，阴道内的其他菌群就会出现异常增生，从而导致阴道炎的发生。
比较常见的由于阴道菌群失调导致的阴道炎，是外阴阴道假丝酵母菌病，即霉菌性阴道炎，还有细菌性阴道病即BV，这两种疾病都是由于阴道内菌群环境失调，所导致的异常菌群增生。外阴阴道假丝酵母菌病是由于阴道内假丝酵母菌的异常增生，而细菌性阴道病则是由于加德纳菌等厌氧菌的异常增生所导致的阴道炎症，无论是哪一种细菌或微生物感染，都需要进行相应处理。
