肛周疼痛是一种比较常见的肛周临床表现，主要发生的原因可能和肛周炎症性疾病有关，比如肛裂、肛窦炎、肛周脓肿、肛瘘等，肛周的炎症性疾病常会在肛周出现红、肿、热、痛等炎症反应。慢性肛周炎症如肛瘘等，红、肿、热的感觉并不明显，而是在肛周出现经久不愈的溃疡，疼痛尽管不严重，但按压时，会有脓血性分泌物不断流出。肛瘘患者只有将瘘管完整切开，使新生肉芽组织由内向外生成，才能彻底治疗。
肛周疼痛另一个常见原因是肛周脓肿，而肛周脓肿常是肛瘘的前身，因此对于肛周脓肿，应及时进行切开引流，并且要注意肛周脓肿进展为肛瘘。有时肛周疼痛是肛裂造成，多数肛裂很难自行愈合，只有进行适当的手术和药物治疗，才能加快肛裂等感染疾病的治疗。
