甲肝灭活疫苗和减毒活疫苗，区别主要在于是否去除致病能力与繁殖能力，以及注射次数、稳定性等，具体如下：

1、去除致病能力与繁殖能力：灭活疫苗已经去除了其相应的致病能力和繁殖能力，主要保留其抗原性。在进入机体以后，会激发机体产生相应的抗体。而减毒活疫苗还具有相应的繁殖能力和抗原性，在进入机体后，会出现繁殖，能够大量激活机体，产生相应的免疫反应。所以减毒活疫苗其毒性反应相对更多，而灭活疫苗相对稳定性会更好，具体二者制作方法也有所区别；

2、注射次数：如果是灭活疫苗，通常可能在注射一针后，产生抗体的持续时间没有减毒活疫苗更持久。所以针对灭活疫苗，可能需要使用更多次的注射，达到强化的效果；

3、稳定性：灭活疫苗相对较稳定、容易保存，而减毒活疫苗相对不稳定。

所以具体要选择甲肝的灭活疫苗，还是减毒活疫苗，要取决于患者情况以及目前所有的疫苗状态。一般来说，两个疫苗相对都比较安全、可靠。