临床上很少用阿莫西林来治疗梅毒，阿莫西林对梅毒的治疗效果无法确定，很多时候治疗效果并不理想。虽然阿莫西林也是属于半合成类青霉素，属于青霉素大家族的一员，但阿莫西林的抗菌活性主要针对的是革兰氏阳性球菌和一些阴性菌，包括阴性的杆菌和阴性的球菌，而对螺旋体的治疗效果无法确定。
梅毒的病原体是梅毒螺旋体，叫苍白密螺旋体，梅毒螺旋体主要敏感的抗生素是长效的青霉素如苄星青霉素和水剂青霉素。如果是普通的梅毒，没有中枢神经系统感染的梅毒，选择长效的苄星青霉素治疗。而如果是存在着中枢神经系统的感染，就选择用水剂的青霉素进行治疗。
所以总而言之，阿莫西林不建议用于治疗梅毒感染，如果是存在梅毒感染，还是建议到医院由专业的医生进行判断。对于非中枢神经系统的梅毒感染，选择使用苄星青霉素，而对于中枢神经系统的梅毒感染，则选择使用水剂青霉素的治疗，不推荐使用阿莫西林来治疗梅毒。
