新生儿低血糖的危害非常大，是必须及时、快速纠正疾病。新生儿低血糖容易造成严重的后遗症，会造成大脑的损伤。低血糖脑损伤往往非常严重，会造成智力低下、频繁抽搐、运动落后。大脑是唯一一个通过糖代谢来提供能量的器官，其它脏器，比如心脏、肝脏、肾脏、肌肉，除了可以代谢糖之外，还可以代谢蛋白质，使蛋白质转成糖，然后再提供能量。大脑没有这个功能，只能通过糖来提供能量。

如果低血糖，就会造成大脑没有能量，大脑细胞就会坏死，就会留有后遗症，对智力、运动、发育造成影响。所以低血糖的后遗症是非常严重的，尤其是持续较长时间的低血糖，会造成严重的神经系统后遗症。