艾滋病抗体检测有一个窗口期概念，指从感染艾滋病病毒到可以在血清中检测到抗体的时期。窗口期虽然检测不到艾滋病抗体，但由于体内已经存在艾滋病病毒，因此窗口期同样存在传染性。
窗口期根据不同检测试剂进行划分，现有诊断技术检测HIV抗体、抗原和核酸的窗口期分别为感染后三周、两周和一周左右，从中可以看出核酸检测窗口期最短，大约是七天，目前这一技术已经应用于各地血液中心。艾滋病抗体检测是第三代试剂，窗口期为三周左右；抗原检测是第四代试剂，窗口期为两周左右。