大部分先天性心脏病在孕期可以检查出来，但对于一些简单的先天性心脏病，比如房间隔缺损、室间隔缺损，因为在胎儿时期左右心室压力相差较小，在胎儿超声检查下是否发现缺损取决于有无血流分流，比如左向右分流或者右向左分流。如果左右心室压力大致相等的情况下看不到分流，心脏超声不一定会发现先天性心脏病。

如果是复杂的先天性心脏病，比如法洛四联症或大动脉转位，以及其它肺动脉瓣闭锁等情况，可以通过心脏超声检查出来。对于先天性心脏病，产前检查推荐超声检查，超声检查无创且无辐射，安全、可靠。