蛔虫的成虫常寄生在人的空肠以及回肠上部，主要附着在肠黏膜表面，可以引起肠黏膜轻度炎症，如果蛔虫数量较多，可以缠绕在一起引起肠梗阻。蛔虫有钻孔的习性，所以经常钻入到胆道，可以引起胆道蛔虫。
也可以进入胰管，引起急性或者慢性的胰腺炎。也可以钻入阑尾，引起阑尾炎样的改变。蛔虫还可以引起异位寄生，可以钻入到脑部 、肺部、腹腔，以及泌尿生殖管道，引起异位蛔虫病。
此外，蛔虫的幼虫可以引起支气管以及肺部的病变，通常虫卵进入消化道系统之后，经过孵育变成幼虫，幼虫可以进入到血液循环系统，然后进入到肺部以及支气管继续发育，可以引起局部炎症表现。
患者常表现为咳嗽以及支气管哮喘，类似于过敏现象。幼虫在肺部继续发育，发育完之后要上行，再进入到口腔，通过唾液再下咽到消化道，在消化道再继续发育为成虫 ，这时才会长期寄生在空肠或者回肠。
