月经干净十几天以后，阴道持续出现咖啡色分泌物，原因具体如下：

1、内分泌紊乱：由于内分泌紊乱导致黄体功能不足，黄体功能不足是由于卵巢在排卵以后，分泌孕酮激素量不够，不足以支持子宫内膜，使得子宫内膜发生部分脱落，此时就会出现少许咖啡色阴道分泌物，这个原因比较常见；

2、炎症性疾病：比如宫颈炎、子宫内膜炎、盆腔炎等，这些炎症性疾病也会导致阴道出现咖啡色分泌物；

3、子宫器质性病变：比如宫颈息肉、子宫肌瘤，特别是黏膜下子宫肌瘤、子宫肌腺症等，这些病变也会引起阴道有少许咖啡色分泌物；

4、宫颈病变：比如宫颈癌前病变，甚至宫颈癌，有时也会出现咖啡色分泌物。

总之，当女性来完月经十几天以后阴道出现咖啡色分泌物，应该及时到医院就诊。