由于造成性功能障碍的原因不同，所以能不能彻底治愈也不能一概而论。多数临床上常见患者的性功能障碍是非器质性病变，这种情况治愈的机会较大，要找到具体环节，比如有无明确的心理、环境、工作、感情上等各方面的原因。如果能找到明确症状，对症下药，有治愈希望。
但是部分疾病，比如神经系统功能障碍，如截瘫的病人，或者是有泌尿系肿瘤、雄激素水平下降的病人，这类病人很难治愈。但是可进行针对性处理，比如激素水平下降，就补充激素。有神经系统功能障碍的患者，做神经调节治疗，包括现有的骶神经调控，对某类少见原因造成的性功能障碍都有帮助。
