鼻咽癌放疗范围包括鼻咽周围的正常组织，颅底神经血管、肌肉，所以周围的正常组织都会受到不同程度的照射。放疗的副作用与照射范围、照射剂量明显相关。一般鼻咽根治性放疗，周边预防剂量最起码在6000mg/m^2，很多正常组织会受到一定影响，最明显的并发症是口腔黏膜反应，会出现口干、味觉改变。

放疗2个星期左右，会出现口腔黏膜丛集性水肿，严重者出现破溃，影响进食，上述是放疗的急性反应。除急性反应外，晚期放疗反应，如放疗后几个月甚至几年出现口干，经过半年左右逐渐减轻，但大部分患者不会完全恢复，还会有不同程度的口干。另外，还有放射性反应，如神经损伤。