细菌性痢疾是由志贺杆菌引起，一般主要包括4个菌，即痢疾志贺菌、福氏志贺菌、宋内志贺菌、鲍氏志贺菌。我国主要流行的是福氏志贺菌和宋内志贺菌。
福氏志贺菌引起的痢疾，一般临床症状相对宋内志贺菌要略重，另外容易引起慢性的细菌性痢疾。而宋内志贺菌引起的痢疾病情一般相对比较轻，引起慢性痢疾的相对比较少。
我国既往主要流行的是这2个志贺菌引起的痢疾，最早是以福氏志贺菌为主，宋内志贺菌相对比较少。但最近这些年随着我国卫生条件的改善，这2个菌现在出现了互换位置。
目前主要的是宋内志贺菌，福氏志贺菌引起的痢疾相对来说在逐渐减少。宋内志贺菌引起的痢疾病情相对表现比较轻，引起慢性痢疾的相对比较少。
目前我国临床发现的痢疾并不是非常典型，主要就是症状表现期，没有典型的脓血便、腹痛以及里急后重这些典型的痢疾症状。而症状相对比较轻，病程相对会明显缩短，引起慢性痢疾相对也比较少。主要是由于我国痢疾志贺菌发生了菌群的变化，主要以宋内志贺菌群为主。
