检查幽门螺杆菌不同的检查方法，对于空腹的要求不同。如果是进行碳13或碳14呼气试验，查幽门螺杆菌要求空腹进行。如果是通过检查大便的幽门螺杆菌抗原，或者抽血检查幽门螺杆菌的抗体，对于空腹没有特别要求。

如果要通过有创检查方法，即通过胃镜检查。在胃镜下取一块胃黏膜组织，可以用快速尿素酶的方法查是否存在幽门螺杆菌感染，或者取组织通过进一步的病理学染色方法判断。此时因为要进行胃镜，而胃镜的要求空腹进行，所以要空腹才能进行幽门螺杆菌检查。目前临床有很多检查幽门螺杆菌的方法，选择不同方法时，对于空腹的要求也不同。