胆汁反流性胃炎的治愈时间因人而异，大部分患者经过6-8周的治疗，病情即可得到较好的控制。但也有部分患者治疗1-3年后，病情也没有得到有效控制。胆汁反流说明幽门机能出现问题，胃和十二指肠的接口称为幽门，是单向出口，故食物从胃中进入小肠后不可再返回到胃中。

而胆汁通过肝脏分泌到胆囊中储存，当摄入食物需胆汁帮助消化时胆囊收缩，胆汁即可到小肠中帮助消化，正常胆汁不会进入胃。但是当幽门机能出现问题，胆汁即可从小肠，即十二指肠进入胃里，称为胆汁反流。而胆汁的化学成分较复杂，胆汁里的胆盐可使胃黏膜受到影响，黏膜保护能力下降而胃中有胃酸，可对胃黏膜造成伤害。