腘窝囊肿手术患者通常需住院4天，虽然住院流程在不同医院存在差异，但大致过程基本相同。

腘窝囊肿手术住院流程为第1天办理入院，入院以后进行术前准备，术前检查需要抽血进行相关指标检测。另外，还需要检测心脏、肺功能是否正常，指标正常则可以进行手术。并且入院后第1天还需要进行肢体准备，例如局部备皮、术前宣教，入院以后第2天可以进行手术治疗。入院第3天，即术后第1天需要进行术后肢体反应观察，明确术后有无特殊情况发生。入院第4天，即术后第2天如果无特殊情况患者可以出院。