宝宝秋季腹泻通常5天左右会好，不超过1周。但腹泻持续时间可能会因严重程度、抵抗力，以及治疗是否及时、有无并发症等原因而存在差异。如果是较轻的秋季腹泻，可能3-5天会痊愈，通常不超过1周。若感染较重或宝宝抵抗力较差，以及没有及时干预，出现脱水及电解质紊乱，此时病程会超过1周。当宝宝出现继发性乳糖不耐受，形成慢性腹泻，甚至会超过2周。不过大部分宝宝属于轻症，比较容易痊愈。

秋季腹泻是肠道病毒感染引发的胃肠型感冒，宝宝可能会出现发烧、呕吐、腹泻等症状，大便呈鸡蛋汤样，此时通常会出现继发电解质紊乱。秋季腹泻的治疗主要是对症治疗，比如宝宝存在呕吐的现象。此时需要止吐，口服补液盐预防和纠正脱水，可以使用收敛止泻的药物，比如蒙脱石散，给予止泻治疗。有一部分宝宝容易出现并发症，甚至出现心肌损伤，此时要针对并发症进行治疗，如果出现继发性乳糖不耐受，则需要服用乳糖酶纠正。