因为心脏射频消融术一般需静脉穿刺，但血管并发症较少见。如需进行左侧旁道射频消融治疗，需穿刺股动脉，血管并发症可能引起穿刺血肿形成。如出现血肿，一般采取压迫止血治疗。

如果血肿不断增大，可能需行心脏彩超检查，明确血肿大小，判断是否存在与其它血管相通现象，以便进一步治疗。此外，心脏射频消融术操作过程中可能误伤希氏束，引起二度或三度房室传导阻滞或导致心脏穿孔，引起心脏压塞等现象。