怀孕40天药物流产，对身体有影响、有伤害。部分女性认为怀孕后进行药物流产，没有进行手术，就对身体没有影响。但其实怀孕后，无论通过哪种方式流产，都有妊娠物从子宫上剥脱的过程。而在剥脱过程中，就会出现感染和出血的可能。

另外因为药物流产，对于组织物的清理，没有人工手术干净，所以经常会有组织物残留。如果一旦出现药物流产不全的情况，则对女性身体伤害会更大。因为此时长期出血，容易造成感染机会增多，也容易出现贫血，必要时有可能还会进行再次手术。所以怀孕40多天，药物流产对身体影响较大，建议尽量做好避孕措施。