包皮上长小疙瘩的原因包括以下几种：

1、脂溢性皮炎：为最常见原因，出现脂溢性皮炎时，会在包皮表面形成脂肪颗粒、小疙瘩样改变，表面呈黄褐色，通常不伴有疼痛或瘙痒症状；

2、扁平疣：出现包皮扁平疣时，也会在包皮表面形成结节样肿物，表面发硬，不伴有疼痛或瘙痒症状；

3、尖锐湿疣：发生尖锐湿疣时，会在包皮和冠状沟间形成乳头状或菜花样肿物，表面发白，触碰时易出血，质地较硬，不伴有疼痛和瘙痒症状，做醋酸试验5分钟后表面出现白色反应，称醋酸试验阳性；

4、毛囊感染：发生毛囊感染时，会形成局部疖肿改变，病人会出现包皮皮肤粉刺样改变。

病人出现上述症状时，需及时到男科或泌尿外科就医。