胰腺囊肿应先判断良恶性，具体处理方法如下：
1、良性肿瘤：假性囊肿＞3cm，若无症状观察即可，除此之外＞3cm的其它肿瘤，均建议进行外科处理。若＜3cm需根据类型进行判断，如导管内黏液腺乳头状肿瘤为主胰管型，建议进行外科处理；＜3cm的实性假乳头性肿瘤，建议处理；
2、恶性肿瘤：无论肿瘤大小，均须进行外科处理。
判断良恶性需通过血肿瘤指标，检查增强CT或磁共振。囊性肿瘤多数可能是低度恶性肿瘤，需进一步检查判断是否需外科处理。