多数药物性肝损伤可以恢复。发生急性药物性肝损伤时，患者停用肝损伤药物，同时应用保肝药物1-2个月，症状消失，肝功能可完全恢复正常。而绝大部分慢性药物性肝损伤患者恢复时间较长，需3个月，甚至3年的时间，肝功能逐渐好转，症状逐渐消失，直至完全恢复。

但若慢性药物性肝损伤发展到了肝硬化，甚至失代偿期肝硬化，这种情况恢复较困难，患者会反复出现腹水、脾脏肿大，甚至引起门脉高压，同时出现一些肝硬化的并发症。胆汁淤积型药物性肝损伤患者往往表现为反复黄疸、白陶土样大便、皮肤瘙痒等，恢复也较困难。除此之外，肝窦阻塞综合征为特殊肝内血管受损的药物性肝损伤，部分患者较难恢复。