男性发生支原体尿道炎时，会在尿道黏膜形成局部破损，导致黏膜水疱形成，病人会出现排尿时尿道隐痛和尿道刺痛的症状，部分病人还会出现尿道瘙痒，多数病人会有尿道口稀薄分泌物。
男性发生衣原体尿道炎时，也会出现尿道刺痒的症状，部分病人也会形成尿道口分泌物，多数伴有尿频、尿急、排尿不尽的症状。致病微生物逆行感染，引起前列腺炎时，还会导致下腹部会阴区局部隐痛的症状，部分病人还会出现射精后，后尿道疼痛的症状。
女性发生支原体感染时，容易发生流产现象，部分病人会出现白带增多，出现阴道炎、宫颈炎等改变。女性发生衣原体感染时，也会导致早产或流产发生，导致宫颈发炎、妇科炎症。发生支原体或衣原体感染时，应及时到泌尿外科就医。
