沙眼衣原体引起沙眼的症状，包括早期和中晚期。早期的感染引起畏光、流泪、异物感、眼睛红肿等表现，如果病情进一步发展，可以累及角膜、眼睑的睑板，出现角膜血管翳或睑板变形，出现内翻、倒睫。

角膜血管翳更进一步加重，出现畏光、流泪，甚至出现角膜混浊、视力下降、视物模糊等。睑板腺的改变引起眼睑位置的变化，出现眼睑内翻、倒睫。内翻、倒睫又加重眼睛不适，出现角膜的损伤加重，流泪、异物感更加明显。

沙眼的流行病学经过解放后卫生条件的极大改善，经济的巨大进步，目前沙眼在我国的患病率已经非常少，而且症状也比较轻微。一般容易把结膜炎与沙眼混为一谈，真正的由沙眼衣原体引起的沙眼比较少见。