乙肝表面抗原和DNA有关系，两者均是在乙肝病毒复制过程中的表达产物。乙肝病毒复制应有DNA阳性，按碱基配对原则完成DNA复制，而乙肝表面抗原是在乙肝病毒复制过程中大量表达，因此乙肝表面抗原和DNA有一定关系，通常为正相关的关系。一般乙肝表面抗原水平越高，复制程度越高，DNA载量也相应升高。

临床中可发现乙肝抗病毒治疗过程中，DNA阴转达到病毒学应答后，乙肝表面抗原受到病毒抑制，表面抗原定量降低，有时DNA阴转一段时间后，表面抗原完全可达到阴性，甚至出现表面抗体，从而达到临床治愈。