霉菌性肺炎是真菌性肺炎，较少见，抵抗力低或生活环境较潮湿，霉菌较多，才易患真菌性肺炎。治疗应用抗真菌药物，目前抗真菌药物种类较多，最简单的是氟康唑、伊曲康唑、科赛斯，有口服和口服液两种，建议口服。

还有静脉制剂，肺炎初期建议使用静脉注射治疗。肺炎控制之后，再口服药物治疗。疗程要比一般肺炎时间长，如为特别严重的患者，肺里形成局部空洞，需要先手术切除，再进行抗真菌治疗。