颅骨缺损在需要进行颅骨修补手术时，至少要进行头颅CT检查。如果作为术前塑形的依据，则要求手术缺损骨窗部位的扫描层厚约为1mm。这样得到CT扫描结果后，能够根据缺损的周边环境以及颅骨外形对其重塑缺损骨窗。所以需要行1mm层厚薄层CT扫描的检查。

其它检查与常规外科手术相同，常规术前检查包括胸部平片，凝血方面检查以及对原发病检查，即颅骨缺损进行病因筛查即可。