幽门螺杆菌感染检查分侵入性和非侵入性两种，两岁以下的儿童考虑进行非侵入性快速尿素酶试验。临床常用碳13、碳14检查，其特异性是77%-100%，敏感度在80-90%左右。

碳14呼气试验有一定放射性，不作为儿童首选的检查项目。碳13检查，比较快速，而且可以明确孩子是否现在存在幽门螺杆菌感染，也可以作为指导治疗的依据。

通过抽血对幽门螺杆菌抗体进行检查，特异性为70%-80%，只能代表既往是否出现过幽门螺杆菌感染，并不能说明现在是否存在幽门螺杆菌感染，所以该检查多用于流行病学调查。