在医学解剖中，门往往是代表血管、神经、管道等出入部位。临床上常指的肝门分为三种：
1、第一肝门是肝脏、肝动脉、肝门静脉，还有肝的胆道进出肝脏的部位，在肝脏下面，称为肝脏的脏面；
2、第二肝门指的是肝经脉离开肝脏的部位，肝脏三个肝静脉，一般是肝左静脉、肝中静脉和肝右静脉，这三根静脉，到最后都离开肝脏进入下腔静脉；肝静脉离开肝脏的部位，称为第二肝门；
3、第三肝门主要指肝短血管、肝脏的一些小的肝静脉，其不通过左、右、中肝静脉进入下腔静脉，直接汇入到下腔静脉，这些细小的肝短血管，有时也把将其称为第三肝门。所以肝门主要是解剖学位置。